在印度尼西亚，对HIV-1B病毒的分子系统发育(进化史)的研究成功地阐明了三个进化枝(病毒的主要分支)的传播时期和途径。其中包括一个印尼独有的进化枝，以及在1970年代和1980年代从泰国，欧洲和美国传播的进化枝。

在AMED的J-GRID计划的资助下，神户大学与印度尼西亚的Airlangga大学之间的研究合作使这项研究成为可能(请参见致谢)。该小组由神冈正典教授和神木大学大学院医学研究科公共卫生学系助理教授Assistant木智宏教授，上田树平研究助理(神户大学医学研究生院传染病研究中心)，纳斯鲁努丁教授组成(Airlangga大学)和大阪公共卫生研究所的元村一志博士。

这些结果已于2019年9月27日发表在国际期刊《科学报告》上。

介绍

HIV(人类免疫缺陷病毒)发展为AIDS(后天免疫缺陷综合症)，自1981年发现第一例病例以来，它仍然是主要的健康威胁。

HIV的基因组成很容易适应和变化。例如。HIV-1 M(主要)是世界上传播最广泛的HIV类型，仅就HIV-1 M而言，其9个亚型中就有100株以上。

人们认为，HIV-1的B型亚型(HIV-1B)起源于中非的刚果民主共和国，并从那里传播到海地和美国。随后，它被传播到欧洲和亚洲，现在遍布全球。

印度尼西亚由17,500多个岛屿组成，拥有世界第四大人口。它还以东南亚地区HIV传播最多的案例，其中以CRF01_AE形式为主要亚型。HIV-1 B亚型(HIV-1B)也很普遍。尽管印度尼西亚的感染率一直在下降，但仍然是一个重大的公共卫生问题。但是，关于印尼病毒的起源，传播和进化的许多方面，人们还不甚了解。

方法

为了进行这项研究，从印度尼西亚爪哇，苏门答腊，巴布亚，苏拉威西岛和其他各个主要岛屿的医疗机构的艾滋病毒患者那里采集了外周血样本。鉴定了HIV-1B基因的32个序列。然后使用密切相关的HIV-1B序列数据库分析这些基因的进化。这些系统发育分析表明，印度尼西亚HIV-1B的主要类型是印度尼西亚进化枝，其次是中国和美国进化枝。

随后对这三个进化枝的分子系统发育进行了深入分析，揭示了它们可能是如何到达印度尼西亚的。结果表明印尼进化枝起源于美国。在1980年代后半叶到达印度尼西亚后，人们认为它已发展成印度尼西亚的独特菌株。中国的进化枝在80年代末从泰国传​​播开来，而美国的进化枝则在80年代中期通过欧洲传播(图1)。总体而言，研究发现，整个1970年代和1980年代，HIV-1B是通过泰国，欧洲和美国多次传入印度尼西亚的(估计最早的病毒引进是在1961年左右)。