DNA元条形码可以改善人类饮食的分析
一项新的研究表明,DNA元条形码是监测人类摄入植物的有力工具,可以帮助研究人员更多地了解我们所吃的食物及其对肠道微生物组的影响。
DNA条形码和元条形码
DNA条形码是一种使用短DNA序列快速识别生物物种的技术。在全球范围内,科学家一直在合作以获取所有生物条形码的条形码。
DNA元条形码是一种特殊类型的条形码,可应用于包含多个生物体的样品。它使用与条形码相同的参考数据库,但允许使用高通量测序方法从混合样本中识别分类单元。该技术的潜力是巨大的,它使得几乎可以在任何样品中确定物种组成。
相对于其他技术的优势
最近发表在mSystems期刊上的当前研究表明,可以使用野生动植物研究中常用的技术对人类粪便样品中的饮食植物DNA进行扩增和测序。
已经使用了许多技术来评估饮食摄入量,但是大多数技术取决于人们对所吃食物的自我报告。这种数据收集方法易受记忆错误和报告偏见的影响,并且取决于个人回答调查问卷的认知能力。
使用DNA元条形码,科学家可以扩增粪便样品中存在的DNA,并使用参考数据库将序列映射到食品上。
“特定的DNA序列作为特定食品种类的唯一标识符”
杜克大学(Duke University)的合著者布莱安娜·彼得罗纳(Brianna Petrone)表示:“我认为DNA超条形码非常像超市中的条形码。我们可以将特定的DNA序列视为特定食品种类的唯一标识符。”
大卫和哈佛大学的第一作者之一阿斯彭·里斯(Aspen Reese)在与普林斯顿大学的生态学家Rob Pringle和布朗大学的Tyler Kartzinel会面后被提示开始研究。这些研究人员使用DNA元条形码技术分析了非洲大草原草食动物之间的复杂食物网。
David和Reese想知道该方法是否也可以用于研究人员。