ClinEpiDB数据资源释放儿童营养不良和肠道疾病研究
随着大数据革命的不断发展,对跨越多个学科的数据的访问变得越来越有价值。在公共卫生领域,共享数据的一个障碍是用户需要充分理解复杂的方法细节和数据变量,以便进行适当的分析。临床流行病学数据库ClinEpiDB.org旨在通过不仅提供大量数据的访问来解决这些障碍,还提供工具来帮助解释复杂的全球流行病学研究。ClinEpiDB的发展由宾夕法尼亚大学艺术与科学学院,佩雷尔曼医学院,佐治亚大学生物信息学研究所,利物浦大学综合生物学研究所合作引领。
3月7日,ClinEpiDB发布了“肠道感染和营养不良的病因,风险因素和相互作用以及儿童健康和发育的后果”的数据,方法和文献(MAL-ED))学习。MAL-ED研究代表了美国国立卫生研究院(FNIH)基金会,Fogarty国际中心和国际调查员网络之间近十年的研究合作。MAL-ED研究旨在帮助识别儿童生命早期的环境暴露,这些环境暴露与身体发育,认知发育和免疫力的不足有关。该研究将肠道功能生物标志物描述为从环境暴露到生长和发育缺陷的因果途径,并评估地理位置在暴露和儿童健康与发育方面的多样性。MAL-ED联盟已经发布了一个重要的同行评审出版物库,ClinEpiDB现在使MAL-ED数据高度可见,并以令人兴奋的新方式获取。
ClinEpiDB也是全球肠道多中心研究(GEMS)的所在地,该研究包含来自南亚和非洲7个地点的22,000多名儿童的数据,是迄今为止研究儿童中度至重度腹泻病原因的最大研究。在中低收入国家。最新的ClinEpiDB版本还包含GEMS1A的数据,这是GEMS研究的延续,扩大了其范围,包括不太严重的腹泻事件。增加MAL-ED增加了高质量的母婴全球健康数据。
“十多年来,我们的国际调查人员网络通过MAL-ED进行合作,以更好地了解肠道感染,营养和其他儿童发育环境暴露之间的复杂关系,”FNIH科学副主任Michael Gottlieb博士说。退休)并担任MAL-ED研究的首席研究员。“MAL-ED网络在各种研究领域产生了高质量的数据集,可能是同类中最大的数据集 - 从认知能力到肠功能到免疫反应。我们很高兴通过ClinEpiDB提供这个数据集,因此它可以是远远未来的研究人员使用它来增加科学认识,测试新的研究假设,并设计和实施更好的干预策略,以降低儿童的发病率和死亡率。“
MAL-ED站点(位于秘鲁伊基托斯;巴西福塔莱萨;坦桑尼亚Haydom;南非林波波;尼泊尔巴克塔普尔;巴基斯坦Naushero Feroze;印度Vellore;孟加拉国达卡)允许在生活在地理和文化多样的城市和乡村环境以及不同经济发展水平国家的儿童。ClinEpiDB中的MAL-ED数据包括人体测量学,营养学,疫苗接种状况,腹泻和呼吸道疾病事件以及2009 - 2014年社区实地工作者收集的无数其他细节的130多万次观察。目前的版本包括儿童的纵向数据,这些数据在生命的前24个月内每周进行两次。未来的数据发布将包含一些5岁以下儿童的数据。ClinEpiDB允许用户通过直观的界面轻松浏览这些数据,实现点击过滤,简单查询和更复杂的“搜索策略”。看到https://youtu。be /535PcFrBH8M用于该资源的视频介绍。ClinEpiDB将继续增长并提供更多的疟疾和母婴健康全球数据集,从而促进开放数据环境中的流行病学研究,同时保护患者身份。